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É a maior bacia localizada inteiramente em território brasileiro, com 813.674,1 km². O rio Tocantins nasce em Goiás e percorre 2.640 até desembocar na foz do Amazonas. Seu trecho navegável, de 1,9 mil km, se encontra em Belém (PA) e Peixe (GO), e parte de seu potencial hidrelétrico é aproveitado pela Usina de Tucuruí. O rio Araguaia nasce em Mato Grosso, na fronteira com Goiás, e une-se ao Tocantins no extremo norte do estado de mesmo nome. A construção da hidrovia Araguaia – Tocantins tem sido questionada pelas ONGs, que criticam os impactos ambientais que ela poderá provocar. A hidrovia cortaria, por exemplo, dez áreas de conservação ambiental e 35 áreas indígenas, afetando uma população de cerca de 10 mil índios.